Можно использовать событие toolTipCreate - в котором переопределять координаты ToolTip'a

Код:
<mx:Application xmlns:mx="http://www.adobe.com/2006/mxml" initialize="initApp()">
<mx:Script><![CDATA[
import mx.core.IToolTip;
import mx.managers.ToolTipManager;
import mx.controls.ToolTip;
import mx.events.ToolTipEvent;
public function initApp():void {
b1.addEventListener(ToolTipEvent.TOOL_TIP_SHOW, myToolTipChanger)
}
public function myToolTipChanger(event:ToolTipEvent):void {
var tooltip:IToolTip=ToolTipManager.currentToolTip
tooltip.text = "Click the button, " + event.currentTarget;
tooltip.x=this.mouseX
tooltip.y=this.mouseY
}
]]> </mx:Script>
<mx:Button id="b1" label="Click Me" toolTip="Click the button"/>
</mx:Application>