Вопрос по установке Flash develop

[illuzor]

но неужели там правда не предусмотрена папка lib? А как же add to library?

Видимо разработчики решили, что эта папка в большинстве случаев не нужна. Лично меня это не смущает совершенно - создать не долго. Add to library работает из любой папки, в конфиг записываются относительные пути.

скажите а где в версии 4.5.1 находится flex?

Flex SDK что ли? Насколько я помню, примерно тут: c:\Program Files (x86)\FlashDevelop\Tools\
Зачем вам это? Он подключается автоматически.
Если нужно создать flex проект: project/new project/flex project

Просто физически я папку References не вижу в проекте.

Этой папки и нет в проекте. Она, если так можно сказать, виртуальная. Вам ведь выше объяснили: в ней отображаются подключённые внешние папки с классами\библиотеками или чем-либо ещё.
Кстати, references намного удобней, чем реализация подключения внешних папок в прошлых версиях fd.

А как же я буду перемещать и копировать файлы swc в References?

Создайте в проекте свою папку (например lib) и в неё складывайте.