как правильно формировать пакеты?

[expl]

Все редакторы кода позволяют сохранить настройки конкретного проекта. Или не все? Если не позволяет - в топку. Таким образом настройки также можно закоммитить.

Как-бы проблема в том что настройки путей (и не только путей) у всех разные. И если их коммитить - у всех кодеров поочерёдно будет переставать собираться. Тут нужны более тонкие подходы.
Ладно, с путями к либам ещё можно договорится (хотя бывали случаи что вот лежит либа на D, а у чувака нет такого диска , он согласен, что у всех должно быть одинаково, но изменить путь на D:\workspace\our-libs не может). Но с путями к компилятору, java-машине и т.д. и т.п. такое уже не прокатывает.

При совместной разработке используйте систему версирования

Как будто можно сделать по-другому. Было бы интересно посмотреть на 2-х кодеров, работающих с одним кодом без системы контроля версий.
... хотя, говорят бывает O_o таджик-свн