Зачем сцены?
Переходи на кадры, а музыкальные файлы вставляй программно.
Например, вот такой код:

Код:
ss0="background.mp3"
ss1="background2.mp3"
ss2="background3.mp3"
soundsource=this["ss"+random(3)];
backsound = new Sound();
backsound.loadSound(soundsource, false);
backsound.onLoad=function(){
backsound.start();
}
Вставь всё это в руте одной сцены которая идёт после интры, то есть не нужно три разных сцены с разными мелодиями, этот код автоматически тебе загрузит случайную мелодию.
Вроде всё работает, сейчас проверил.