Вспомните, как происходит стирание в векторных редакторах - в том же Flash IDE. Там изменяется вектор, по которому проходят стиралкой.
И убрать точки здесь не достаточно - здесь надо искать точки пересечения области стиралки с линиями, дробить линию на куски, удалять куски, попавшие в область стирания.
А если у Вас не просто линии, а ещё и области заливки - задача становится ещё интереснее - придётся использовать хитрые алгоритмы по работе с контурами.
Но такого редактора я на flash не видел. Переходите на растр и не выпендривайтесь
... или рисуйте поверх закрашенные цветом фона контуры.