[bav]

(yourMovieClip.parent as MovieClip).someFunction();

Но вообще-то так делать не рекомендуется. Используйте события.

Добавлено через 5 минут
Например вот так:
В главном классе (имя которого будет прописано в Document class) пишем:

package {
    import flash.display.MovieClip;
    import flash.events.Event;
 
    public class MyClass extends MovieClip {
        // Конструктор класса
        public function MyClass() {
            // Добавляем клипу прослушку события
            yourMovieClip.addEventListener(Event.CHANGE, someFunction);
        }
        // Определяем функцию-хендлер
        private function someFunction(event:Event):void {
            trace("Hell-o-World!");
        }
    }
}

А когда нужно вызвать функцию someFunction(), шлем из клипа соответствующее событие:

dispatchEvent(new Event(Event.CHANGE));