Наверное не поняли
Или что-то делаете не так...
Я имею ввиду компилируете свое приложение, потом swf который получаете нужно "заембедить" в отдельном классе и скомпилировать этот класс. Дополнительно можно базовый swf взять как ByteArray и зашифровать. А при "ембединге", вернее перед добавлением в дисплей лист расшифровать.
Попробуйте просмотреть ресурсы этой флешки.