Попробуйте сделать еще одну флешку размером в один пиксель, но не transparent (пусть посылает javascript-у) и связать ее с основной (которая wmode="transparent") при помощи LocallConection и как это будет работать?
Я попробовал, не очень...
http://dnadillo.dn.ua/fla/js-swf-htm...ml.html#f_call
Opera просто не может wmode="transparent" ее начинает сильно плющить...