Берем 2 файла.
Первый:
PHP код:
<?php
...
exec('абсолютный путь ко 2 файлу >/dev/null 2>&1 &');
...
?>
Второй:
PHP код:
#!/usr/local/php/bin/php //путь к интерпритатору может отличаться
<?php
//то что нужно пустить в фоне
?>
первый файл запускает в фоне из браузера второй файл и все. только второму нужно выставить права на исполнение