я сталкивался с такой траблой - кстати AS 3.0 тут не причём...
это непонятный глюк компиляции. перекомпиль подгружаемый квадрат - на кройняк поствь stop(); у него в кадре (даже если он единственный и ничего там нет) сам непонимаю почему - но такая вот фигня..... мммм ... срабатывает!
я помню игру делал так мне приходилось из за этого (вспомнил) - заходить в исходник и копаться по уровням, до максимального уровня элемента (ну например игра была на двойке и я прогонял все пути _root.mc1.mc2.mc3 и.т.д. чтобы небыло ничего выделеного (ну там элементы в синей рамке или шейпы )) прогонял , жал Ctrl+Enter и чудеса (!) глюк пропал.
если интересно могу ещё несколько глюков описать в флеше
З.Ы у меня тоже глюки не наблюдаются...
З.Ы.Ы я проблему описал как решать на двойке - а в тройке незнаю сам думай =)