[rtm]

Это всеравно не спасет Вас от того, чтобы кто-то очень любопытный не залез на эту страницу. Флешку можно расковырять и найти этот "некоторый параметр, который известен только флэшу" и отправить его ручками (не нада рассказывать, что метод POST тут поможет, так как он не поможет, будет чуточку не удобно, но вполне реально). Не поможет даже шифрование.
Другими словами этот Ваш "секретный" скрипт, а точнее результаты его работы можно достать если к ним есть хоть какой-то доступ.
P.S. "Никакая компьютерная система не может быть абсолютно защищенной, если к ней есть хоть какой-то доступ." (с) Кто-то из очень умных программистов-администраторов, но не помню кто.