[MerlinTwi]

О! Появился. А я уж, по затянувшемуся молчанию решил, что тебя за сорванные сроки с картой заказчик порешил

Координаты просто, на каждую точку 4 байта, значит надо позиционироваться на 4*(y*ширина_прямоугольника + x) и читать значение.

// заливаем все красным
var bitmap:BitmapData = new BitmapData(10,10,false,0xFF0000);
// ставим синюю точку в 2:3
bitmap.setPixel(2,3,0x0000FF);
// считываем ByteArray прямоугольника 5 на 5
var rect:Rectangle = new Rectangle(0,0,5,5);
var byteArray:ByteArray = bitmap.getPixels(rect);
// показываем цвет точки в 2:3
trace(getPixel(2,3, byteArray,rect).toString(16));
// и на всякий случай в 3:3
trace(getPixel(3,3, byteArray,rect).toString(16));

// возвращает 32 цвет точки
function getPixel(x:Number, y:Number, b:ByteArray, r:Rectangle):Number {
	b.position = (y*r.width + x)*4;
	return b.readUnsignedInt();
}