во первых ты плюсуешь getTimer() к текущим секундам( а надо бы к стартовым)
во вторых там непонятка возникает из-за второго кадра в мувике
я бы так сделал (убрав второй кадр):

Код:
sec=sec0=55;
min=12;
hour=24;
this.onEnterFrame=function(){
nexts=(Math.floor(getTimer()/1000)+sec0)%60
if(nexts!=sec) {
sec=nexts;
if(sec==0) {min++;min %=60}
if(min==0) {hour++;hour %=24;}
div=":";
time=hour+div+(min<10 ? "0"+min : min) +div+(sec<10 ? "0"+sec : sec);
}
}