[caseyryan]

Может имелась в виду разница между object и swfobject?
Потому что в айфрейм флешка так же встраивается одним из этих путей, и вопрос в этом плане не корректный.
iFrame - это простая html страница внутри другой страницы. Но при этом она может находиться совсем на другом домене. Так что для флешки разница будет в том, что для загрузки ресурсов надо будет получать файл кроссдоменной политики с того домена, на котором находится айфрейм, а не основная страница