Скорее всего когда вызывается ваша JS функция
to_flash() из контейнера, у флешке не успевает зарегистрироваться функция
send, по которому контейнер может осуществить вызов функции у флешке.
Попробуйте вызывать в контейнере функцию инициализации после регистрации, вот так:

Код AS3:
ExternalInterface.addCallback("send", from_js);
// Отправляем контейнеру что приложение загрузилось
ExternalInterface.call('initApp');
Вот часть кода контейнера:

Код:
/**
* Функция вызывается из флешки, и сообщает, что приложение загрузилось и все функции зарегистрированы.
*/
function initApp()
{
to_flash( 'Hello' );
}