[caseyryan]

А что нужно-то?
Можно писать два парралельных проекта внутри одного. Каждый из них будет иметь свой документ класс, его нужно лишь назначить и скомпилировать. Но я бы так не делал. Если есть возможность, то лучше делать для каждой флешки свой проект. Тем более, что переключение между проектами в ФД происходит быстро и легко.