Добрый день,
Честно скажу, про Animate не знаю вообще ничего.
Что касается разработки для AppStore, там сначала нужно стать разработчиком, потом будет доступна панель на сайте
https://developer.apple.com/ на которой можно создавать сертификаты и провизион профили.
Заливать на AppStore для тестирования на нескольких конкретных айфонах необходимости нет, но нужно сделать Development-сертификат (в формате p12) и Development-провизион. При создании провизиона указать в нем перечень UDID девайсов, на которых можно запускать приложение.
Для загрузки на AppStore по-любому нужен мак, поскольку заливка производится через XCode и Application Loader, которые работают только на маке.
Создание сертификата p12 тоже на маке происходит в один клик, а на виндовз это пляски с бубнами.