Юнити изначально 3д движок, transform - это компонента 3д объектов.
т.е. сортировкой занимается движок исходя из фактической геометрии объекта в глобальном окружении.
Для 2д существует несколько подходов, в 2d toolkit (неофициальная тулза) - самостоятельно управляют z координатой. В официальном 2д есть Layers.
2Babylon - вместо того чтобы спрашивать на форуме флэшеров - почитали бы доки и туторы на сайте юнити. Там довольно подробно всё разжёвано.
доки
http://docs.unity3d.com/ScriptReference/index.html
туторы
http://learnunity2d.com/
http://www.raywenderlich.com/61532/u...etting-started