Создайте в директории проекта еще одну директорию с именем "fscommand", положите туда ваш файл и выполните в ролике команду

Код AS1/AS2:
fscommand('exec', 'имя_файла.exe' );
Основной ролик должен быть скомпилирован в EXE, запускаемый тоже нужно сделать EXE.