Как же вы видео в проект внедряли тогда? Готовые flv-шки брали?
Такое ощущение складывается, что вы не свой проект ковыряете.
По поводу "вырезать лишнее".
Какой вы нелюбопытный.

Потыкаться по вкладкам - а?
"Crop and Resize"...
А маски на размер ролика не повлияют.