Смотря с чем сравнивать

Что до ошибки: убедитесь, что вы правите именно тот конфиг, который нужно (самый простой способ - урезать хип до каких-нибудь 16Мб, если оно все еще запускается - значит конфиг не тот...

)
Кроме того, есть вариант, что памяти не хватает не компилятору, а Эклипсу, тогда ищите его конфигурацию (я если чесно не знаю, где она в Виндовс, в Линукс она будет, как правило в /etc/eclipse.ini).