[wvxvw]

Так FlexLoader - это же тот же самый Loader только ему toString() переопределили... Для простоты - используйте SWFLoader, но можно в приниципе и обычным лоадером, только вам нужно будет дождаться загрузки второго фрейма, найти класс Application в этом втором фрейме, и уже его добавлять в список отображения. Разбираться в этом месиве дело неблагодарное, так что я бы использовал SWFLoader.
И не называйте переменный с прописной - вас так никто не поймет.