Флешка не получила фокуса, поэтому onMouseWheel и не работает.
Если где-то работает сразу, значит фокус на флешку установлен (например, принудительно, с помощью JavaScript).
По вашей ссылке вероятнее всего, именно так, там большой файл JS подключается.
А в вашем примере в режиме standalone у меня например, скролится без клика.
В общем случае с таким поведением приходится мириться.
http://www.flasher.ru/forum/showthread.php?t=128338
Для AS3 было наиболее комфортное
решение от etc для работы c фокусом и onMouseWheel.
Изменились ли обстоятельства для 10-го плеера, не могу сказать.