Если вы в свойствах клипа указываете Export for ActionScript, при условии что сами не писали класс для данного клипа, Flash IDE автоматически создает класс с именем, которое вы указываете в поле Class. Поэтому такой клип точно будет связан с классом, без разницы кем созданным, вами или Flash IDE. И далее кодом уже можно создавать экземпляры данного клипа (Class: MyClip).

Код AS3:
package
{
import flash.display.MovieClip;
public class Temp extends MovieClip
{
public function Temp()
{
var example:MovieClip = new MyClip();
addChild(example);
}
}
}