[expl]

Не надо путать оптимизацию с рефакторингом

Самое минимальное что можно сделать - заменить clickOffSet3a и clickOffset3b на словать:

var clickOffSetByShipCell:Dictionary = new Dictionary();
 
function startShipDrag(event:MouseEvent)
{
        var shipCell:Field = event.target;
	setChildIndex(shipCell, numChildren - 1);
	clickOffSetByShipCell[shipCell] = new Point(event.localX,event.localY);	
}
 
function stopShipDrag(event:MouseEvent)
{
        var shipCell:Field = event.target;
	clickOffSetByShipCell[shipCell] = null;
}
 
function dragshipCell(event:Event)
{
        var shipCell:Field = event.target;
        var offset:Point = clickOffSetByShipCell[shipCell];
	if (offset != null)
	{
		shipCell3a.x = mouseX - offset.x;
		shipCell3a.y = mouseY - offset.y;
	}
}

После этого в голову должны прийти более светлые идеи, ну или идея "ну ё нафиг и так сойдет".