можно попробовать globalToLocal тогда все объекты внутри мувиклипов будут находится на определенной позиции относительно глобальной системы координат

Код AS3:
var point:Point = new Point(stage.stageWidth - obj.width, 0);
obj.x = obj.parent.globalToLocal(point).x;
и можно не волноваться, объект 100% будет справа
