Если честно, не знаю в чем проблема

Но непонятно зачем вы используете одновременно UploadPostHelper и FileReference#upload ?
Файл и пост параметры отправляются без участия UploadPostHelper. Разве что вы хотите отправить на сервер модифицированный файл, но тогда зачем вы используете FileReference#upload?
Добавлено через 1 минуту
Мне кажется что вы просто все перепутали. А может и я ничего не понял из представленного куска