[alexberkut]

Я так понял что на флексе у тебя есть 2 класса:
BasicObject
и
ElDocument extends BasicObject

На яве у тебя тоже должно быть 2 класса:
BasicObject
и
ElDocument extends BasicObject

притом оба класса на флексе должны быть pарегестрированны:
registerClassAlias("BasicObject", "BasicObject");
registerClassAlias("ElDocument", "ElDocument");
или через [RemoteClass], но это работает не всегда.

если же ты замапил 1 ява класс на два флексовых, то будет такой эффект.

Если же ты на флексе зарегистрировал 1 класс BasicObject и с явы пытаешь послать ElDocument, который на яве наследуется от BasicObject. То на флексе тебе прилетит не то, ибо флекс сериализует/десериализует один к одному (по мапе) и про наследование он ничего не знает и знать не будет.

ЗЫ: Множественное наследование - это когда класс наследуется от нескольких классов-родителей. Скажем:
ElDocument extends BasicObject, SecondObject.
Такое в яве и флексе не поддерживается