Попробуйте для начала заменить в коде публикации
Код:
<param name="wmode" value="transparent" />
режим на value="window" и посмотрите, что получится.
Это для того, чтобы отключить возможное участие флешки в структуре документа, чтобы стили для нее убить. Если после этого заработает, возможно проблема в z-индексе блока с флешкой.
А вообще value="window" лечит много косяков, в том числе и баги не разработчика.