[Juice_Green]

определили как локальную переменную, определите как свойство класса и тогда будет работать первый вариант

package {
	import flash.display.MovieClip;
	import flash.filters.GlowFilter;
	import flash.utils.*;
	import flash.events.TimerEvent;
	public class eee extends MovieClip {
		private var myTimer:Timer;
 
		public function eee() {
			myTimer = new Timer(50, 500);
	                myTimer.addEventListener("timer", eedduu);
 	                myTimer.start();
		}
		private function eedduu(event:TimerEvent):void{
			myTimer.stop();
		}
	}
}