Используйте класс LoadVars и обработчик его события onLoad и все получится.
Никогда больше не используйте loadVariables.
Добавлено через 4 минуты

Код AS1/AS2:
var txtcolor:Color = new Color(_root.mainc.yellow);
var lv:LoadVars = new LoadVars();
lv.onLoad = function (success:Boolean) {
if (success) {
txtcolor.setRGB(this.cl);
}
};
lv.load ('color.txt');
Причина проблемы - в асинхронности загрузки данных извне и работы кода.
setRGB у вас отрабатывалась раньше, чем успевали загрузиться данные о цвете из файла.
Обработчики событий класса LoadVars решают эту проблему.