[mooncar]

К сожалению, движение кружочков происходит на таймлайне, а не организовано программно. Поэтому для начала нужно разобраться, как их останавливать независимо.

Для этого предлагаю вам поместить каждое движение в мувик, а на таймлайне оставить один кадр.

Допустим, мы добились этого.

Теперь нужно ввести постоянную проверку hitTest кружочков на пересечение с мувиками станций, с каждой причем. Учитываем при этом иерархию родительских связей - то есть адресацию - где какой мувик расположен.

Если hitTest срабатывает, то включается функция задержки - стоп анимации данного мувика с кружочком и одновременно включение отсчета через setTimeout. По истечении таймера должна включиться функция, котрая опять запускает анимацию мувика с кружочком через play().

PS - Проще всего создать два мувика с анимацией движения кружочков, скопировав в каждый из них гид-слой и на другой слой мувика положить уже кружочек.
В общем-то ничего неординарного я не вижу, должно все получиться.
Создаете интервальную функцию, которая проверяет hitTest при каждом вызове через интервал и с каждой станцией.

Если хотите, могу попробовать накидать - небольшая, но достаточно забавная задачка.