[Molecula]

Была такая проблема, но с Фаером, тот выдавал хрень, что мол блокирует поп-апы, сразу не перейти.
Я делал переход через Явафункции.
Флеш вызывает яву, а та уже переадресовывает.

Баннер по идее должен в "_blank"-е вызываться.