[silin]

что происходит: у всех кнопок в обработчике клика одна и та же переменная i (итератор цикла), со всеми вытекающими отсюда последствиями..
как бы сделал:
clpArr[i] должен быть не Sprite'ом, а его наследником, имеющим свойство id , которое при создании в цикле и определим, а в обработчике клика его стало быть увидим
за вычетом несущественного:

package {
	import flash.display.*;
	import flash.events.*;

	public class elGetClipArt extends Sprite{
		public var clpArr:Array = [];
		
		public function elGetClipArt(){
		   for (var i:int = 0; i < 3; i++){
			   var clip:MySprite = new MySprite(i);
			   clip.x = 45 * i;
			   addChild(clip);
			   clip.addEventListener(MouseEvent.MOUSE_UP, clipClickHandler);
			   clpArr.push(clip);
			}
		}
		private function clipClickHandler(event:MouseEvent):void {
			var clip:MySprite = event.target as MySprite;
			var id:int = clip.id;
			trace( "id : " + id );

		}
	}
}

import flash.display.*;
class MySprite extends Sprite{
	public var id:int;
	public function MySprite(id:int) {
		this.id = id;
		//debug
		graphics.lineStyle(50);
		graphics.lineTo(1, 1);
	}
}