[alexcon314]

В хэлпе к экстенжну написано:

This extension primarily requires window handles to be specified so that the method can communicate with the specified window.
To retrieve a list of running window handles use System.getWIndowList();

Так что все правильно делаете.
По поводу получения хэндла нужного окна. У меня нормально работала такая схема:

mdm.System.exec('calc');
formTitle = 'Калькулятор';// титл окна
go.onRelease = function() {
	var wList = mdm.System.getWindowList();
	var appList:Array = new Array();
	var hWnd = 0;
	var i = 0;
	while (wList[i][1]) {
		if (wList[i][0] == formTitle) {
			hWnd = wList[i][1];
		}
		i++;
	}
	//mdm.prompt(hWnd);
	if (hWnd) {
		var Result = mdm.Extensions.ExtWindow.SetPosition(hWnd, 100, 100, true);
	}
};

Интересная чехарда возникает, когда пара калькуляторов запущено .