если речь о новых окнах, то возможно пройдет такой фокус:
ExternalInterface позволяет выполнить любую js-функцию, даже если она не определена на html-страничке, например:
Код:
import flash.external.ExternalInterface;
ExternalInterface.call('function(){alert("flash"); return "OK";}');
т.е. теоретически можно открыть новое окно, передав в виде строки соответствующую функцию..
не пробовал, сказать получиться ли не могу..
ps
нюанс: ExternalInterface будет работать,если в параметрах вставки флешки не стоит allowScriptAccess="never", что, вероятно, тоже проблема в этом случае..