[Molecula]

1) У Твинов есть stop() and resume();
2) Зачем двигать каждый мув, двигайте контенер, в котором Вы их наплодили.
Т.е.:

flow_up_count = 9;
for (i = 1; i < flow_up_count; i++) {
	clip = _root.flow_up1.createEmptyMovieClip("flow_up" + i + "_mc", i);
	clip._y = (i - 1)*260;
	_root.my_mcl.loadClip("flow1_up" + i + ".jpg",clip);
	_root.flow_up1.onEnterFrame=moveHolder;
       function moveHolder() {
		this._x += 5;
		}
	}