Делюся.
ns.seek() (без всяких медиасерверов) такого сделать не может.
Поэтому, попределив текущую (новую) позицию ползунка, отправляемся к файлу PHP - ns.play(
http://path/to/phpFile?polzunokPosition = newposition), предав ему в переменной
PHP файл читает flv

PHP код:
fread(), fseek()
и отдает флешу файл с нужной позиции.
С точки зрения PHP отдает как атачмент

PHP код:
header("Content-Disposition: attachment;)
Все просто, но промучался фиг знает сколько.