[etc]

Это проблема, наблюдаемая в конкретном проекте. Мне не удалось воспроизвести её. Сделал связку BaseClass > TestClass > AnotherTestClass (в BaseClass ничего нет, в TestClass описан метод, в AnotherTestClass метод переписан и вызывает сначала метод супер-класса), никаких проблем не наблюдаю. Вполне возможно, где-то конфликт имен переменных, пакетов, замещение классов и т.п. неприятности.