Собственно говоря серверным скриптом.
Допустим php, тогда при нажатии кнопки во флеше передаем php страницы массив из наших точек, далее юзаем к примеру
int imagesetpixel ( resource image, int x, int y, int color)
и сохраняем его к примеру так:
imagejpeg("newimage.jpg");
Проблемм помоему никаких нет. Я вот, допустим, для себя эту тему открыл после вашего вопроса и очень быстро поиском получил всё необходимое.
Проблемма в понимании клиент-серверной логики, я думаю.
Ну если вы понимаете о чём я
.