Не очень понял.
попробуй так: в html'e

Код:
<a href='asfunction:Run,path_to_file><u>ссылка</u></a>
в коде ехе:

Код:
function Run(path:String){
mdm.System.exec(path);
}
Только путь укажи так C:\\Folder\\<filename> - c двойным слэшем. И в html'e не заключай его в кавычки

Код:
<a href='asfunction:Run,с:\\Folder\\myfile.txt'><u>ссылка</u></a>