[Kikasso]

Только надо сажать время последнего захода на сайт, а потом проверять разницу. Час, допустим, прошел - показывай анимацию, не прошел - обновляй время последнего захода на сайт и не показывай анимацию.
Если есть php на сервере, можно открывать сессию и впечатывать flashvars-ами флажок для показа прелоудера, тогда это будет жить до закрытия броузера.