Это типа портоны и электроны? Тогда, насколько я помню школьную физику, не особо похоже. Кажется мне, что частицы не пребывают в состоянии полной неподвижности (начальное положение частиц в симуляторе), что электроны должны не врезаться в протоны (и отскакивать), а вращаться вокруг положительно заряженного ядра, что атомы водорода и гелия - это очень стабильные образования, и вроде, в симуляторе нейтроны и протоны скорее должны "слипнуться" в некую устойчивую конфигурацию...
Впрочем, по образованию я - филолог, так что, вполне возможно, я не прав
.