посмотри тут
http://www.mantisbt.org/
http://www.bugzilla.org/
http://www.atlassian.com/software/jira/
(правда тут еще и сервер нужно будет оживлять ) Это системы больше для коммандной разработки %)
http://www.download3000.com/download...reg-14458.html - типа локальная, незнаю че такое первое что я нашел в гугле %).
//TODO : очень хорошо поддерживает FDT в проектах,
во флексе, кривоватый туду (
я лично пользовался мантисой, Microsoft Office SharePoint Portal Server(незнаю как оно првильно звучит), видел jiru.
Поищи по гуглу, должен найти еще что-то