Допустим класс называется так: com.company.pack.AnyClass
Значит, в той же папке с исходником создаем папку com, в ней company, далее pack, а в pack кладем файл AnyClass.as с содержимым класса, т.е. получается путь com/company/pack/AnyClass.as
Далее в исходнике:

Код:
import com.company.pack.AnyClass;
var a:AnyClass = new AnyClass();
…