[CGandA]

 
_root.stop

это остановит анимацию на главном таймлайне, а если есть мувики с вложенной анимацией, они продолжают проигрываться.
Надо использовать доп.библиотеку (Evgeniy Potapenko). Там есть метод pause, который остановит всю вложенную анимацию