Не надо 00 + i, тогда на шаге 27 ты получишь не 027, а 0027. Надо просто не пользоваться одной и той же переменной.

Код:
for ( var i = 0; i < 100; i++ )
{
if ( i < 10 ) var j = String("0" + i);
if ( i < 100 ) j = String ("0" + i);
delete this["q" + j];
}