[kruasan]

Принцип такой: экспортится то, что ты видишь на main timeline.
Анимация символов экспортится, если они имеют тип Graphic. Если в твоей анимации не задействованы скрипты, то тип MovieClip тебе вообще не нужен. Реализуй всю анимашку средствами символов Graphic и все нормально просчитается в секвенцию.
Конечно, если ты анимируешь обьекты скриптами, то без capture не обойтись.