[Nirva]

потому, что пхп к загрузке страниц твоим броузером ни имеет ни малейшего отношения.
тогда используй ифреймы. перезагружать страницу означает перезагружать все ее содержимое. если флеш - часть содержимого страницы, то и его нада будет перезагружать.