Можно предположить, что ты дублируешь клипы примерно так:

Код:
on(release){
for(i=1;i<=4;i++){
_root.duplicateMovieClip("qqq","qqq"+i,i); // или qqq. duplicateMovieClip("qqq"+i, i);
и т.д.......
}
То есть, клип "qqq" лежит в _root, и копируешь ты в _root. На разные уровни, но -все-таки - из _root в _root.
Теперь твоя презентация подгружается в другой мувик. Наверняка, она подгружается в кокой-то клип. Допустим "holder". Теперь клип, который раньше был "_root.qqq", теперь стал "_root.holder.qqq". Пути изменились. А скрипт – нет.
Вот и вся проблема.